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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
12/02/2021 |
Data da última atualização: |
12/02/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
RODRIGUES, A. F. G.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; OLIVEIRA, H. C. de; SAVOLDI, I. R.; SOUZA, M. R.; MORES, M. A. Z.; CARREÑO, L. O. D.; LEDUR, M. C. |
Afiliação: |
ARIENE FERNANDA GRANDO RODRIGUES, UDESC/Chapecó; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; HANIEL CEDRAZ DE OLIVEIRA, UFV; IGOR RICARDO SAVOLDI, UDESC/Chapecó; MAYLA REGINA SOUZA, UFRGS; MARCOS ANTONIO ZANELLA MORES, CNPSA; LUIS ORLANDO DUITAMA CARREÑO, BRF/Curitiba; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
Título: |
Genes and SNPs Involved with Scrotal and Umbilical Hernia in Pigs. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Genes, v. 12, n. 166, 2021. |
DOI: |
https://doi.org/10.3390/genes12020166 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract: Hernia is one of the most common defects in pigs. The most prevalent are the scrotal (SH), inguinal (IH) and umbilical (UH) hernias. We compared the inguinal ring transcriptome of normal and SH-affected pigs with the umbilical ring transcriptome of normal and UH-affected pigs to discover genes and pathways involved with the development of both types of hernia. A total of 13,307 transcripts was expressed in the inguinal and 13,302 in the umbilical ring tissues with 94.91% of them present in both tissues. From those, 35 genes were differentially expressed in both groups, participating in 108 biological processes. A total of 67 polymorphisms was identified in the inguinal ring and 76 in the umbilical ring tissue, of which 11 and 14 were novel, respectively. A single nucleotide polymorphism (SNP) with deleterious function was identified in the integrin α M (ITGAM) gene. The microtubule associated protein 1 light chain 3 (MAP1LC3C), vitrin (VIT), aggrecan (ACAN), alkaline ceramidase 2 (ACER2), potassium calcium-activated channel subfamily M 1 (KCNMA1) and synaptopodin 2 (SYNPO2) genes are highlighted as candidates to trigger both types of hernia. We generated the first comparative study of the pig umbilical and inguinal ring transcriptomes, contributing to the understanding of the genetic mechanism involved with these two types of hernia in pigs and probably in other mammals. |
Palavras-Chave: |
Congenital defects; Defeitos congênitos; Expressão genetica; RNA-Seq. |
Thesagro: |
Melhoramento Genético Animal; Suíno. |
Thesaurus Nal: |
Gene expression; Swine; Transcriptomics. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02388naa a2200349 a 4500 001 2130032 005 2021-02-12 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.3390/genes12020166$2DOI 100 1 $aRODRIGUES, A. F. G. 245 $aGenes and SNPs Involved with Scrotal and Umbilical Hernia in Pigs.$h[electronic resource] 260 $c2021 520 $aAbstract: Hernia is one of the most common defects in pigs. The most prevalent are the scrotal (SH), inguinal (IH) and umbilical (UH) hernias. We compared the inguinal ring transcriptome of normal and SH-affected pigs with the umbilical ring transcriptome of normal and UH-affected pigs to discover genes and pathways involved with the development of both types of hernia. A total of 13,307 transcripts was expressed in the inguinal and 13,302 in the umbilical ring tissues with 94.91% of them present in both tissues. From those, 35 genes were differentially expressed in both groups, participating in 108 biological processes. A total of 67 polymorphisms was identified in the inguinal ring and 76 in the umbilical ring tissue, of which 11 and 14 were novel, respectively. A single nucleotide polymorphism (SNP) with deleterious function was identified in the integrin α M (ITGAM) gene. The microtubule associated protein 1 light chain 3 (MAP1LC3C), vitrin (VIT), aggrecan (ACAN), alkaline ceramidase 2 (ACER2), potassium calcium-activated channel subfamily M 1 (KCNMA1) and synaptopodin 2 (SYNPO2) genes are highlighted as candidates to trigger both types of hernia. We generated the first comparative study of the pig umbilical and inguinal ring transcriptomes, contributing to the understanding of the genetic mechanism involved with these two types of hernia in pigs and probably in other mammals. 650 $aGene expression 650 $aSwine 650 $aTranscriptomics 650 $aMelhoramento Genético Animal 650 $aSuíno 653 $aCongenital defects 653 $aDefeitos congênitos 653 $aExpressão genetica 653 $aRNA-Seq 700 1 $aIBELLI, A. M. G. 700 1 $aPEIXOTO, J. de O. 700 1 $aCANTAO, M. E. 700 1 $aOLIVEIRA, H. C. de 700 1 $aSAVOLDI, I. R. 700 1 $aSOUZA, M. R. 700 1 $aMORES, M. A. Z. 700 1 $aCARREÑO, L. O. D. 700 1 $aLEDUR, M. C. 773 $tGenes$gv. 12, n. 166, 2021.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Registros recuperados : 31 | |
3. | | KOWACIC, R. da C.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PALUDO, E.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Padronização da técnica de high resolution melting para detecção de um SNP no gene da calmodulina em galinhas. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 9., 2015, Concórdia. Anais... Brasília: Embrapa, 2015. p. 135-136.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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4. | | FRIGO, A.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Identificação de SNPs nos genes MYH2 e CLIC4 associados à hérnia umbilical em suínos. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13., 2019, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2019. p. 32-33. JINC 2019.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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5. | | SAVOLDI, I. R.; PETRY, B.; CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Expressão do gene PTHLH em frangos de corte normais e afetados pela necrose da cabeça do fêmur. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., 2016, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2017. p. 13-14. JINC.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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6. | | SAVOLDI, I. R.; PETRY, B.; CARMO, K. B. do; MARCIANO, C. M. M.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Seleção de genes constitutivos para estudos de expressão gênica em ossos de frangos de corte aos 35 dias de idade. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 10., 2016, Concórdia. Anais... Brasília: Embrapa, 2016. p. 28-29.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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7. | | CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; ONO, R. K.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Associação de um SNP no gene da calmodulina com características de integridade da tíbia em frangos de corte. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., 2016, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2017. p. 69-70. JINC.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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8. | | SAVOLDI, I. R.; KOWACIC, R. da C.; IBELLI, A. M. G.; LOPES, L. dos S.; PALUDO, E.; ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Avaliação fenotípica do fêmur e da tíbia de frangos de corte afetados ou não com problemas locomotores. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 9., 2015, Concórdia. Anais... Brasília: Embrapa, 2015. p. 104-105.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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9. | | HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SOUZA, M. R.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO D. E. P.; TREMEA, M.; LEDUR, M. C. Reference genes for proximal femoral epiphysiolysis expression studies in broilers cartilage. Plos One, v. 15, n.8, Ed. e0238189, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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10. | | PETRY, B.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PALUDO, E.; PEIXOTO, J. de O.; JAENISCH, F. R. F.; CUCCO, D. de C.; LEDUR, M. C. New genes involved in the Bacterial Chondronecrosis with Osteomyelitis in commercial broilers. Livestock Science, v. 208, p. 33-39, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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11. | | TREMEA, M.; HUL, L. M.; SAVOLDI, I. R.; ESTER, D.; AULER, M. E.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Expressão diferencial do gene GAL1 entre frangos de corte normais e afetados com condronecrose bacteriana com osteomelite. Avicultura Industrial, Itu, ed. 1301, ano 111, n. 07, p. 42-44, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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12. | | MARCIANO, C. M. M.; SAVOLDI, I. R.; KARMO, K. B. do; CUCCO, D. de C.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Expressão diferencial do gene MYLK2 em frangos de corte normais e afetados com White striping. In: SEMINÁRIO DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO DA UDESC OESTE, 8.; VIGÉSSIMO OITAVO SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 28.; PRIMEIRO ENCONTRO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UDESC OESTE, 2018, Chapecó. Anais... Chapecó: UDESC Oeste, 2019. 8º SEPE. 28º SIC. 1 º EPG.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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13. | | CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; PEIXOTO, J. de O.; MARCIANO, C. M. M.; LEDUR, M. C. Expressão do gene CHST-1 em frangos de corte normais e afetados pela necrose da cabeça do fêmur. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 10., 2016, Concórdia. Anais... Brasília: Embrapa, 2016. p. 32-33.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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14. | | MARCELINO, D. E. P.; SOUZA, M. R.; AULER, M. E.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O. Expressão dos genes MAP1LC3C e EPYC em suínos normais e afetados com hérnia umbilical. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13., 2019, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2019. p. 34-35. JINC 2019.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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15. | | SAVOLDI, I. R.; PALUDO, E.; CARMO, K. B. do; PETRY, B.; IBELLI, A. M. G.; ONO, R. K.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C. Fatores que influenciam características de integridade óssea e expressão dos genes COL 1A2 e RAMKL em frangos de corte. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., 2016, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2017. p. 67-68. JINC.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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17. | | IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; MORES, N.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Biological processes related to ribosome and mitochondrial functions might be involved in the osteochondrosis latens manifestation in gilts. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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18. | | PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; JAENISCH, F. R. F.; GIACHETTO, P. F.; SETTLES, M. L.; ZANELLA, R.; MARCHESI, J. A. P.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Proximal femoral head transcriptome reveals novel candidate genes related to epiphysiolysis in broiler chickens. BMC Genomics, v. 20, p. 1-17, 2019. Na publicação: José Rodrigo Pandolfi. Article number: 1031.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Suínos e Aves. |
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19. | | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; MORÉS, N.; MORES, M. A. Z.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; PERTILLE, F.; MARIANI, P. D. S. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Perfil de metilação diferencial no cromossomo 6 de suínos normais e afetados com osteocondrose latens. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13., 2019, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2019. p. 36-37. JINC 2019.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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20. | | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; SALMÓRIA, L. A.; MORES, M. A. Z.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; PERTILLE, F.; MARIANI, P. D. S. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Perfil de metilação diferencial em suínos normais e afetados com osteocondrose latens. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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